Dưới sự chỉ đạo của Ban Giám hiệu Trường Đại học Y khoa Phạm Ngọc Thạch, sự hỗ trợ chuyên môn của GS. Hội Hồ và GS. Hồ Kim Tuyến (Viện Đại học Sức khỏe Texas Tech El Paso, Hoa Kỳ), Trường Đại học Y khoa Phạm Ngọc Thạch đã thành lập Đơn vị Phát triển Giảng viên thông qua Quyết định số 1254/QĐ-TĐHYKPNT ngày 06 tháng 4 năm 2020.
Qua 03 năm hình thành và phát triển (2020 – 2023), Đơn vị Phát triển Giảng viên đã phụ trách các lớp Đào tạo và Phát triển Giảng viên trong chương trình hợp tác với Viện Đại học Sức khỏe Texas Tech El Paso như: (1) Các lớp CEP (Collaboration Education Program), (2) Các lớp AFDP (Advance Faculty Development Program). Bên cạnh đó, Đơn vị Phát triển Giảng viên đã và đang tiếp tục mở các lớp “Đào tạo và Phát triển giảng viên” cho toàn thể các giảng viên của Trường, cũng như tổ chức các Hội thảo chia sẻ về Giáo dục Y học.
Ngày 01 tháng 5 năm 2023, Đơn vị Phát triển Giảng viên được sáp nhập vào Phòng Tổ chức Cán bộ theo Quyết định số 1438/QĐ-TĐHYKPNT ngày 28 tháng 4 năm 2023.
Để đáp ứng nhu cầu đào tạo của Nhà trường và phù hợp với hội nhập quốc tế, ngày 05 tháng 12 năm 2023, Trung tâm Giáo dục Y học được thành lập trên cơ sở từ Đơn vị Phát triển Giảng viên, theo Quyết định số 4539/QĐ-TĐHYKPNT ngày 05 tháng 12 năm 2023 về việc thành lập Trung tâm Giáo dục Y học thuộc Trường Đại học Y khoa Phạm Ngọc Thạch.
Trung tâm Giáo dục Y học vẫn đang trên con đường hoàn thành sứ mạng của mình là Nâng cao chất lượng của đội ngũ giảng viên, nhân viên y tế và học viên của Trường Đại học Y khoa Phạm Ngọc Thạch, các Trường Y khoa và đơn vị Y tế khác thông qua các hoạt động đào tạo, huấn luyện nhằm nâng cao năng lực giảng dạy, lượng giá, lão đạo và nghiên cứu khoa học. Góp phần vào công cuộc hoàn thành sứ mạng "Đào tạo nguồn nhân lực y tế chất lượng cao, nghiên cứu khoa học và phục vụ cộng đồng" của Trường Đại học Y khoa Phạm Ngọc Thạch.